隐孢子虫属于原生动物，寄生于动物体中国和人体中，可引起隐孢子虫病。寄生于人体内部的微小隐孢子虫，是一种治病原虫，可以导致严重腹泻的一种腹泻病原，且具有感染性。在国外，由于隐孢子虫而引起的大面积腹泻症状和致死报道和对其的研究，使隐孢子虫越来越受到全世界的关注。1984年隐孢子虫病被证实可经水质传播，英美欧等地区报道供水系统爆发隐孢子虫病的问题。
1987年在美国的佐治亚州，大约有1.3万居民同时发生了肠炎症状，在自来水中找到了隐孢子虫的囊卵，这是历史上首次隐孢子虫病通过市政供水系统大规模爆发。1993年，美国威斯康星州的市政供水系统又一次被隐孢子虫污染，40万人同时腹泻。1987年在国内也发现了人体隐孢子虫病的病例，随后其他一些省市也相续报道了一些病例，在腹泻患者中，隐孢子虫的检出率达13.3%。在发生疫情的饮用水处理系统中，消毒工艺均采用氧化消毒法（包括氯气、次氯酸钠、二氧化氯和氯胺），经检验氯化系统运行正常，并且保障足够的余氯量和接触时间，大量事实和研究表明，传统的氯化消毒方法不能提供足够的剂量，在隐孢子虫侵入时不足以确保饮用水的供水卫生。
紫外线消毒技术的不断进步和紫外线消毒反应器的不断完善，从1993年对隐孢子虫90%去除率，达到1999年99.9%的去除率，紫外线技术已被认可为适合杀灭隐孢子虫和贾弟鞭毛虫，以及杀灭大肠杆菌的技术，特别适用于地表水、自来水等水体。
1987年在美国的佐治亚州，大约有1.3万居民同时发生了肠炎症状，在自来水中找到了隐孢子虫的囊卵，这是历史上首次隐孢子虫病通过市政供水系统大规模爆发。1993年，美国威斯康星州的市政供水系统又一次被隐孢子虫污染，40万人同时腹泻。1987年在国内也发现了人体隐孢子虫病的病例，随后其他一些省市也相续报道了一些病例，在腹泻患者中，隐孢子虫的检出率达13.3%。在发生疫情的饮用水处理系统中，消毒工艺均采用氧化消毒法（包括氯气、次氯酸钠、二氧化氯和氯胺），经检验氯化系统运行正常，并且保障足够的余氯量和接触时间，大量事实和研究表明，传统的氯化消毒方法不能提供足够的剂量，在隐孢子虫侵入时不足以确保饮用水的供水卫生。
紫外线消毒技术的不断进步和紫外线消毒反应器的不断完善，从1993年对隐孢子虫90%去除率，达到1999年99.9%的去除率，紫外线技术已被认可为适合杀灭隐孢子虫和贾弟鞭毛虫，以及杀灭大肠杆菌的技术，特别适用于地表水、自来水等水体。